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晶體日記(十八)- 尋找反常和有趣- X射線衍射XRD

更新時(shí)間:2024-08-28點(diǎn)擊次數(shù):454

突然看到飛機(jī)上的某位同學(xué)在那么努力的看文獻(xiàn)。敬業(yè)的精神著實(shí)很難得..幾日前講課,突然想到自己的學(xué)生和工作過往,發(fā)出也許是故作深沉的感慨:Boring again。從學(xué)校到公司,從一份工作到另一份工作,在某個(gè)時(shí)間點(diǎn)突然開始Boring起來。也許工作本就如此,大多數(shù)時(shí)間被無聊的事情的占據(jù)著,我們能做的無外乎自己努力地保持著Active的心態(tài)罷了。

出現(xiàn)反常

不過聽課的老師,倒是覺得20多年來,總是遇到不同的東西,不會(huì)覺得Boring。是呀,遇到新的問題,解決了,才會(huì)有成就感。但之后的體力勞動(dòng)著實(shí)更加費(fèi)時(shí)間??赡苡型瑢W(xué)會(huì)問我,我說的是做什么?晶體學(xué)嗎?對(duì),我說的是結(jié)構(gòu)精修… 所以,我經(jīng)常跟很多同學(xué)說,尊重下科學(xué),尊重下幫你解決問題的老師們??赡芤?yàn)槟阒蛔非蠛每炊ヌ舸痰慕Y(jié)果,給幫助你的人帶來了很多負(fù)面的情緒。其中的過程,你可能無法知道死了多少腦細(xì)胞。

在Routine的工作里,尋找反常,也許是消除這些Boring的好方式。然而大多數(shù)結(jié)果是,你在跟同學(xué)們討論這是很有趣的結(jié)果是,他的答案會(huì)是:“我不要反常,這和我的預(yù)期結(jié)果不一致,能改一改嗎?能消除嗎?"… 好吧,我又忍不住開始吐槽了…

“反常"晶體分析

近期的半年里發(fā)現(xiàn)的“反常"晶體,依舊遵循著有意思的扎堆定律。我開始想這樣的晶體是如何生長(zhǎng)出的,自然界里是不是有相同的共生?確實(shí)近期發(fā)生的概率有點(diǎn)大。

也許是固定習(xí)慣思維的影響,看到這些晶體,可能一個(gè)反應(yīng)是,這不就是自己PPT里的孿晶嗎?然后在繼續(xù)做的時(shí)候,就充滿了困惑了。亦或是自己仔細(xì)一點(diǎn)就會(huì)發(fā)現(xiàn),這只是看起來很像罷了。

因?yàn)楝F(xiàn)在APEX5 Determine Unit Cell的Domain功能很方便,也許在拆完一個(gè)domain之后,也就自動(dòng)的讓它找第二個(gè)Domain了。然而結(jié)果會(huì)讓你大失所望,怎么不按套路來了呢?第二個(gè)Domain并沒有覆蓋到多少剩余的衍射點(diǎn),而且和預(yù)想的并不符合。

難道做錯(cuò)了,然而不管從哪個(gè)角度去分離衍射點(diǎn),得到的結(jié)果都是這樣。

既然Domain功能并沒有達(dá)到預(yù)期,肯定是有原因的?;氐狡鸪鯇W(xué)習(xí)的方式,按部就班的手動(dòng)分離衍射點(diǎn)下來,并且把共有的衍射點(diǎn)都分配到兩組衍射點(diǎn)里。自然發(fā)現(xiàn)了其中的問題所在。

第二個(gè)domain 獨(dú)自定出的晶胞,與一個(gè)晶胞有相同的體積,然而β角卻幾乎是90°,接近于正交的晶胞。所以這并不是一個(gè)剛看到時(shí)以為的Twinning。自然Cell_now, Domain也都不會(huì)找到正確的結(jié)果。有意思的是,用兩個(gè)不同的晶胞都可以分別解出相應(yīng)的結(jié)構(gòu),只是無法精修的更好。因?yàn)楫吘褂?0%的overlap。此時(shí)APEX5的Ignore功能可能會(huì)有些作用,但是完整度會(huì)缺失很多,所以并沒有解決問題。結(jié)構(gòu)沒有發(fā)表,就不展示了。
接受反常,變有趣(X射線衍射XRD)

那么這個(gè)晶體是怎么回事呢?猜測(cè)下來,這可能是一個(gè)inter-grow的共生晶體,從一個(gè)共同的面上長(zhǎng)出了兩種不同的晶型。當(dāng)然也無法從晶體中剝離其中的一個(gè)。具體怎么解決這樣的問題,還在嘗試之中。如果有誰曾經(jīng)有過處理的經(jīng)驗(yàn),可以教教我。突然想起,其實(shí)5年前就遇到過了,當(dāng)時(shí)只是認(rèn)為學(xué)生挑錯(cuò)了晶體… 好吧,看來并不是。

反常的東西,反而會(huì)變的更有趣一點(diǎn)。接受反常,給出合理的解釋,也許才能在Boring中找到新的感興趣的點(diǎn)。

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